77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0537 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
428 aa  869    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  42.82 
 
 
419 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  39.81 
 
 
426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  39.42 
 
 
421 aa  279  8e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 
411 aa  218  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 
411 aa  217  4e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
411 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.05 
 
 
429 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
406 aa  211  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 
406 aa  211  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.75 
 
 
411 aa  208  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.65 
 
 
411 aa  207  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.53 
 
 
414 aa  206  7e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 
411 aa  203  5e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 
406 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
406 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 
406 aa  197  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.93 
 
 
406 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.96 
 
 
409 aa  187  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.57 
 
 
409 aa  186  5e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 
409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.08 
 
 
401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.53 
 
 
401 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.12 
 
 
401 aa  178  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 
395 aa  178  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 
402 aa  177  4e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  31.74 
 
 
401 aa  176  6e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 
403 aa  172  9e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 
413 aa  171  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.33 
 
 
402 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  30.86 
 
 
384 aa  168  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.47 
 
 
432 aa  166  5e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
401 aa  166  6.9999999999999995e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  31.34 
 
 
383 aa  160  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  31.97 
 
 
387 aa  159  7e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 
409 aa  156  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.08 
 
 
385 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.76 
 
 
401 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 
398 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29 
 
 
426 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
402 aa  150  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  26.73 
 
 
392 aa  146  6e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.71 
 
 
433 aa  145  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.35 
 
 
426 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 
399 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  27.79 
 
 
405 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.44 
 
 
401 aa  144  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.99 
 
 
393 aa  143  7e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 
398 aa  143  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
399 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  25.88 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  28.09 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.83 
 
 
393 aa  141  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  27.85 
 
 
426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.5 
 
 
426 aa  139  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  28.92 
 
 
403 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  28.5 
 
 
402 aa  137  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  28.13 
 
 
407 aa  136  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  29.5 
 
 
383 aa  136  8e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 
399 aa  136  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.28 
 
 
403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 
397 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  25.69 
 
 
393 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  27.29 
 
 
402 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  26.49 
 
 
397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.24 
 
 
396 aa  124  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.34 
 
 
399 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.34 
 
 
399 aa  122  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  26.91 
 
 
428 aa  118  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  26.89 
 
 
428 aa  117  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  25.12 
 
 
402 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  26.3 
 
 
428 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  26.91 
 
 
429 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  22.57 
 
 
392 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  22.27 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  32.76 
 
 
421 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>