94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1818 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 399 aa  820    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  80.7 
 
 		 399 aa  684    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  72.73 
 
 		 397 aa  609  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  65.91 
 
 		 399 aa  566  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  66.17 
 
 		 399 aa  567  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  66.17 
 
 		 398 aa  545  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  64.41 
 
 		 399 aa  535  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  62.91 
 
 		 401 aa  534  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  52.25 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  52.37 
 
 		 403 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  54.4 
 
 		 398 aa  437  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  52.39 
 
 		 397 aa  428  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  54.36 
 
 		 392 aa  422  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  51.87 
 
 		 401 aa  423  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  50.99 
 
 		 402 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  54.09 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  50.5 
 
 		 404 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  51.25 
 
 		 407 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  51.6 
 
 		 402 aa  388  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  48.61 
 
 		 384 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  50.68 
 
 		 385 aa  366  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  47.79 
 
 		 387 aa  346  5e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  44.75 
 
 		 393 aa  343  4e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  45.59 
 
 		 383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  44 
 
 		 393 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  47.69 
 
 		 383 aa  333  3e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  43.25 
 
 		 393 aa  333  4e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  44 
 
 		 396 aa  332  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  43.5 
 
 		 398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  42.12 
 
 		 402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.86 
 
 		 406 aa  223  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.21 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 		 406 aa  206  8e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.44 
 
 		 411 aa  205  9e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.15 
 
 		 411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.25 
 
 		 406 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 		 413 aa  196  5.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.74 
 
 		 409 aa  195  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 		 378 aa  187  4e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.46 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.84 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.66 
 
 		 429 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 411 aa  176  8e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.06 
 
 		 421 aa  169  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.08 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  33.09 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  30.45 
 
 		 392 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.81 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 401 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.91 
 
 		 402 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 403 aa  144  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  28.71 
 
 		 409 aa  142  9e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  29.16 
 
 		 401 aa  140  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.2 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.81 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.99 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.21 
 
 		 433 aa  116  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  23.44 
 
 		 426 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  24.05 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.5 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.47 
 
 		 432 aa  112  9e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  28.77 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  24.64 
 
 		 428 aa  90.9  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  24.48 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  22.7 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  28.18 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  20.33 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  30.06 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  23.56 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  38.71 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  39.68 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  35.48 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  28.68 
 
 		 351 aa  49.7  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0395  regulatory protein  33.87 
 
 		 306 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2210  phosphoglyceromutase  32.61 
 
 		 532 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251733 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  38.6 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  33.33 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  29.21 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  23.87 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0891  phosphoglyceromutase  29.41 
 
 		 490 aa  43.9  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1757  hypothetical protein  27.54 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.870085  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16361  phosphoglyceromutase  32.56 
 
 		 540 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>