79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0824 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  100 
 
 		 433 aa  880    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  38.86 
 
 		 432 aa  300  3e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 		 426 aa  239  8e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.96 
 
 		 426 aa  239  9e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.66 
 
 		 426 aa  236  6e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.25 
 
 		 426 aa  236  7e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.41 
 
 		 406 aa  229  7e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.41 
 
 		 406 aa  226  6e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 		 406 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  36.97 
 
 		 429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.13 
 
 		 411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.45 
 
 		 409 aa  196  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.82 
 
 		 411 aa  194  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 428 aa  192  9e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 428 aa  189  7e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  29.25 
 
 		 428 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  27.7 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.9 
 
 		 411 aa  176  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  30.7 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.22 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.78 
 
 		 426 aa  150  6e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.09 
 
 		 401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 401 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  30.24 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.73 
 
 		 419 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.31 
 
 		 414 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  26.99 
 
 		 403 aa  140  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  29.93 
 
 		 384 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 413 aa  136  9e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 401 aa  134  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.61 
 
 		 398 aa  133  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.16 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.75 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  26.68 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 401 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.19 
 
 		 399 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  30.57 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.67 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.38 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  29.16 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  27.49 
 
 		 402 aa  127  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.74 
 
 		 385 aa  126  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  27.4 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 397 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.1 
 
 		 409 aa  122  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  29.23 
 
 		 409 aa  120  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 399 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  27.57 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  27.42 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.51 
 
 		 401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.46 
 
 		 398 aa  113  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 		 408 aa  113  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 409 aa  111  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 		 398 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.17 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  28.64 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  25.42 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  24.71 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.94 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  25.3 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  25.18 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  25.3 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  25.97 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  26.47 
 
 		 378 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  31.58 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  29.91 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0891  phosphoglyceromutase  26.4 
 
 		 490 aa  45.8  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0355  Phosphopentomutase  36.05 
 
 		 402 aa  44.3  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>