79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1930 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  100 
 
 		 398 aa  805    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  57.14 
 
 		 396 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  45.74 
 
 		 407 aa  322  6e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  48.11 
 
 		 402 aa  321  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  43.5 
 
 		 399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  47.11 
 
 		 401 aa  314  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  41.65 
 
 		 399 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  43.53 
 
 		 397 aa  310  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  40.25 
 
 		 399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.29 
 
 		 398 aa  301  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  42.72 
 
 		 405 aa  297  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  40.8 
 
 		 401 aa  295  6e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  39.9 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  40.65 
 
 		 392 aa  292  9e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  41.53 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  40.65 
 
 		 399 aa  289  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  39.75 
 
 		 397 aa  281  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  39.16 
 
 		 402 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  37.87 
 
 		 403 aa  278  8e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  39.95 
 
 		 383 aa  277  3e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  39.6 
 
 		 404 aa  276  4e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  38.15 
 
 		 385 aa  270  5e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  40.1 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  39.85 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  38.4 
 
 		 387 aa  258  2e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  38.61 
 
 		 402 aa  255  9e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 393 aa  229  6e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.75 
 
 		 393 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  37.78 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.41 
 
 		 411 aa  193  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.92 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.52 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  36.2 
 
 		 378 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.3 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.27 
 
 		 411 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 406 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 406 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.9 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.83 
 
 		 411 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.48 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.17 
 
 		 409 aa  164  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.62 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  35.55 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.37 
 
 		 411 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.98 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  25.88 
 
 		 428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.96 
 
 		 419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 403 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.16 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.39 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 401 aa  124  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  29.83 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.74 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.29 
 
 		 409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.11 
 
 		 402 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.29 
 
 		 432 aa  110  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 402 aa  111  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  27.3 
 
 		 401 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.33 
 
 		 401 aa  106  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.62 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.58 
 
 		 433 aa  103  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.62 
 
 		 426 aa  95.1  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  25.37 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  23.51 
 
 		 426 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  23.63 
 
 		 426 aa  87  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  23.21 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  22.97 
 
 		 429 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  23.66 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  22.99 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0140  phosphopentomutase  34.88 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0425  metalloenzyme domain protein  32.94 
 
 		 284 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>