80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3387 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  100 
 
 		 396 aa  806    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  57.14 
 
 		 398 aa  432  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  46.57 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  44 
 
 		 399 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  43.69 
 
 		 397 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  44.17 
 
 		 401 aa  319  6e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  44.08 
 
 		 398 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.5 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  41.19 
 
 		 399 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  39.6 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  44.7 
 
 		 399 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  40.9 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.75 
 
 		 398 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  42.54 
 
 		 401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  41.65 
 
 		 392 aa  299  7e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  45.52 
 
 		 402 aa  295  8e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  39.45 
 
 		 403 aa  295  9e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  42.08 
 
 		 384 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  43.72 
 
 		 397 aa  283  5.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  43.7 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  39.11 
 
 		 402 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  39.45 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  40.35 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  40.88 
 
 		 385 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  38.92 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  38.64 
 
 		 383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  38.4 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 393 aa  239  5e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 		 393 aa  239  5e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.86 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.62 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 406 aa  180  4e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.81 
 
 		 414 aa  178  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 		 406 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.11 
 
 		 411 aa  170  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 		 378 aa  170  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 		 411 aa  168  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.23 
 
 		 411 aa  167  2e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 411 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.13 
 
 		 426 aa  159  6e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 		 413 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.17 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.92 
 
 		 429 aa  152  7e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.42 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 411 aa  150  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 		 421 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.38 
 
 		 419 aa  146  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.02 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 409 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.07 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.13 
 
 		 409 aa  136  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.02 
 
 		 421 aa  132  6.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  30.9 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 406 aa  129  6e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  26.24 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.75 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 		 395 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.85 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 401 aa  112  9e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.46 
 
 		 402 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  23.41 
 
 		 432 aa  107  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  26.55 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  23.77 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.34 
 
 		 433 aa  96.7  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.35 
 
 		 426 aa  93.2  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.5 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  19.88 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  20.51 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  18.33 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  18.87 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0425  metalloenzyme domain protein  33.33 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  32.32 
 
 		 516 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  30 
 
 		 513 aa  43.1  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>