110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0447 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  100 
 
 
385 aa  785    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  63.61 
 
 
384 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  60.99 
 
 
383 aa  483  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  62.3 
 
 
383 aa  478  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  55.21 
 
 
387 aa  430  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  52.03 
 
 
398 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  52.92 
 
 
401 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  50.51 
 
 
392 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  48.22 
 
 
401 aa  382  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  49.24 
 
 
399 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  48.99 
 
 
399 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  50.68 
 
 
399 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  47.78 
 
 
397 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  53.2 
 
 
399 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  48.28 
 
 
399 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  46.31 
 
 
397 aa  350  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  47.78 
 
 
402 aa  348  7e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  49.11 
 
 
398 aa  348  8e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  45.66 
 
 
407 aa  348  9e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  47 
 
 
402 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  45.48 
 
 
404 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  46.12 
 
 
403 aa  335  5.999999999999999e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  46.15 
 
 
405 aa  335  7e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  44.67 
 
 
402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  44.5 
 
 
402 aa  316  4e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  43.2 
 
 
393 aa  305  6e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  44 
 
 
393 aa  302  8.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  43.2 
 
 
393 aa  294  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  38.15 
 
 
398 aa  270  4e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  40.88 
 
 
396 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  36.34 
 
 
411 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  36.1 
 
 
414 aa  223  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.86 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 
406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.84 
 
 
406 aa  210  4e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.66 
 
 
409 aa  207  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 
406 aa  207  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.34 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 
413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 
411 aa  195  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.08 
 
 
411 aa  194  2e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 
411 aa  194  3e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.83 
 
 
411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.45 
 
 
429 aa  186  8e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.81 
 
 
426 aa  176  5e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.83 
 
 
419 aa  175  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 
406 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 
392 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 
401 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.43 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  31.08 
 
 
428 aa  153  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.36 
 
 
421 aa  152  7e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 
402 aa  149  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.08 
 
 
401 aa  149  6e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.68 
 
 
409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  29.77 
 
 
409 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  30.93 
 
 
401 aa  146  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 
395 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.64 
 
 
401 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.64 
 
 
403 aa  143  6e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 
403 aa  139  8.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.82 
 
 
408 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.79 
 
 
409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.69 
 
 
402 aa  130  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 
378 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  26.72 
 
 
426 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.92 
 
 
433 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.28 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.76 
 
 
432 aa  116  6e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.11 
 
 
426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 
421 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  23.66 
 
 
426 aa  94  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  24.87 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  24.56 
 
 
428 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  24.07 
 
 
429 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  23.51 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  31.63 
 
 
339 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  30.1 
 
 
317 aa  50.4  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0891  phosphoglyceromutase  29.76 
 
 
490 aa  49.3  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  32.99 
 
 
512 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  31.82 
 
 
512 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  31.25 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  29.84 
 
 
515 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  24 
 
 
350 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  28.46 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  32.69 
 
 
513 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  29.84 
 
 
515 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  31.91 
 
 
512 aa  45.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  24.5 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  30.43 
 
 
511 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  31.25 
 
 
504 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16241  phosphoglyceromutase  36.92 
 
 
540 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2868  phosphoglyceromutase  31.15 
 
 
514 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000729439  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  32.93 
 
 
514 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  36.84 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  30.43 
 
 
508 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16361  phosphoglyceromutase  28.32 
 
 
540 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  30.43 
 
 
511 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  30.43 
 
 
511 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>