97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2140 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  100 
 
 		 403 aa  830    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  67.83 
 
 		 402 aa  581  1e-164  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  55.58 
 
 		 402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  53.06 
 
 		 404 aa  444  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  52.37 
 
 		 399 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  52.61 
 
 		 405 aa  438  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  53.37 
 
 		 399 aa  434  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  53.37 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  51.86 
 
 		 401 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  52.24 
 
 		 399 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  51.74 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  51.49 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  51.24 
 
 		 399 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  47.42 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  48.02 
 
 		 392 aa  385  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  47.03 
 
 		 401 aa  381  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  48.4 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  44.99 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  44.67 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  45 
 
 		 383 aa  347  3e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  45 
 
 		 384 aa  345  8e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  46.12 
 
 		 385 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  44.3 
 
 		 383 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  40.59 
 
 		 393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  41.4 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  41.09 
 
 		 393 aa  316  4e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  40.84 
 
 		 393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  39.45 
 
 		 396 aa  295  9e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  40.73 
 
 		 402 aa  290  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  37.87 
 
 		 398 aa  278  8e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.57 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.27 
 
 		 406 aa  210  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 406 aa  209  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.19 
 
 		 406 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 406 aa  206  7e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 406 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.93 
 
 		 414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.16 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.17 
 
 		 411 aa  192  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.81 
 
 		 413 aa  191  1e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.81 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.6 
 
 		 419 aa  182  9.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.93 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.54 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.19 
 
 		 421 aa  163  6e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  30.24 
 
 		 406 aa  160  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  31.11 
 
 		 378 aa  159  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  28.15 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 428 aa  138  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.06 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.06 
 
 		 401 aa  137  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.14 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.68 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.95 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  25.69 
 
 		 409 aa  129  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.72 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.59 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  28.44 
 
 		 421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.84 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  27.25 
 
 		 426 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.07 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  26.01 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  25.64 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.69 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  28.77 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  25.55 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  25.39 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  25.14 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  24.42 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  23.77 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  21.7 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  30 
 
 		 350 aa  53.5  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1886  hypothetical protein  28.24 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0384  phosphoglyceromutase  32.97 
 
 		 504 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  28.26 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  26.67 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0891  phosphoglyceromutase  25.57 
 
 		 490 aa  46.2  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1565  hypothetical protein  28.09 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491571  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  21.5 
 
 		 533 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1447  hypothetical protein  26.56 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.944051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0343  phosphoglyceromutase  31.87 
 
 		 504 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0555548  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2204  hypothetical protein  28.24 
 
 		 358 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3114  hypothetical protein  28.24 
 
 		 358 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2587  hypothetical protein  28.24 
 
 		 358 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  27.83 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2719  hypothetical protein  28.24 
 
 		 541 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2641  hypothetical protein  28.24 
 
 		 358 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.192728  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1697  hypothetical protein  28.24 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1477  hypothetical protein  28.24 
 
 		 358 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  25.32 
 
 		 301 aa  43.9  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0436  phosphoglyceromutase  29.67 
 
 		 504 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>