55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1447 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1447  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  721    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.944051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2568  hypothetical protein  76.86 
 
 
388 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133782  normal  0.0201135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1565  hypothetical protein  80.11 
 
 
372 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491571  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2115  hypothetical protein  72.1 
 
 
358 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0320662  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5962  hypothetical protein  72.1 
 
 
358 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1155  hypothetical protein  72.93 
 
 
358 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0968736  normal  0.0377322 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2133  hypothetical protein  72.1 
 
 
358 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.089753 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5421  hypothetical protein  72.93 
 
 
358 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2025  hypothetical protein  73.76 
 
 
358 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.604471 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2152  hypothetical protein  73.48 
 
 
358 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0374202  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1886  hypothetical protein  67.11 
 
 
380 aa  476  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1697  hypothetical protein  69.23 
 
 
407 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2719  hypothetical protein  69.23 
 
 
541 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1477  hypothetical protein  68.89 
 
 
358 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2641  hypothetical protein  68.89 
 
 
358 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.192728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2587  hypothetical protein  68.89 
 
 
358 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3114  hypothetical protein  68.89 
 
 
358 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2204  hypothetical protein  68.89 
 
 
358 aa  461  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1116  putative signal peptide protein  44.03 
 
 
359 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0385568  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  41.83 
 
 
366 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1039  hypothetical protein  40.33 
 
 
372 aa  235  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.306566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0959  conserved hypothetical signal peptide protein  42.42 
 
 
359 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279719  normal  0.0122892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1055  putative signal peptide protein  42.7 
 
 
359 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23362  normal  0.366612 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2750  putative signal peptide protein  33.54 
 
 
309 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  29.3 
 
 
348 aa  134  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3423  hypothetical protein  38.05 
 
 
318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0488  hypothetical protein  31.61 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2757  hypothetical protein  37.78 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3701  hypothetical protein  37.25 
 
 
318 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1469  hypothetical protein  39.13 
 
 
326 aa  125  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  33.44 
 
 
356 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1209  hypothetical protein  32.76 
 
 
322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3182  hypothetical protein  30.42 
 
 
326 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3233  hypothetical protein  29.13 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.294837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5405  hypothetical protein  34.5 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.562328  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2399  putative signal peptide protein  35.18 
 
 
346 aa  109  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1459  hypothetical protein  31.27 
 
 
341 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  28.57 
 
 
350 aa  106  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  28 
 
 
345 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3257  hypothetical protein  29.31 
 
 
316 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1013  hypothetical protein  30.42 
 
 
362 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  33.87 
 
 
334 aa  99  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  36.94 
 
 
317 aa  97.4  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  29.07 
 
 
351 aa  97.1  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  26.35 
 
 
301 aa  87  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  31.65 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  33.72 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  33.33 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0395  regulatory protein  26.75 
 
 
306 aa  61.2  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  26.96 
 
 
306 aa  59.7  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0980  hypothetical protein  31.82 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.979605  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  25.38 
 
 
403 aa  46.6  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  24.67 
 
 
399 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  25.65 
 
 
399 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>