56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2152 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2025  hypothetical protein  99.44 
 
 		 358 aa  702    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.604471 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2133  hypothetical protein  93.02 
 
 		 358 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.089753 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5421  hypothetical protein  93.58 
 
 		 358 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2115  hypothetical protein  92.46 
 
 		 358 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0320662  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2152  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0374202  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5962  hypothetical protein  92.46 
 
 		 358 aa  664    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1155  hypothetical protein  89.66 
 
 		 358 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0968736  normal  0.0377322 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1886  hypothetical protein  74.59 
 
 		 380 aa  503  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1447  hypothetical protein  73.48 
 
 		 364 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.944051 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1697  hypothetical protein  76.03 
 
 		 407 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2719  hypothetical protein  76.03 
 
 		 541 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3114  hypothetical protein  75.77 
 
 		 358 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1477  hypothetical protein  75.77 
 
 		 358 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2641  hypothetical protein  75.77 
 
 		 358 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.192728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2587  hypothetical protein  75.77 
 
 		 358 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2204  hypothetical protein  75.77 
 
 		 358 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1565  hypothetical protein  69.19 
 
 		 372 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491571  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2568  hypothetical protein  66.58 
 
 		 388 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133782  normal  0.0201135 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1116  putative signal peptide protein  45.54 
 
 		 359 aa  259  6e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0385568  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  41.48 
 
 		 366 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0959  conserved hypothetical signal peptide protein  41.93 
 
 		 359 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279719  normal  0.0122892 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1039  hypothetical protein  39.78 
 
 		 372 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.306566 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1055  putative signal peptide protein  41.93 
 
 		 359 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23362  normal  0.366612 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2750  putative signal peptide protein  34.67 
 
 		 309 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  31.05 
 
 		 348 aa  142  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  34.68 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3423  hypothetical protein  36.89 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2757  hypothetical protein  36.32 
 
 		 318 aa  126  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3701  hypothetical protein  36.77 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0488  hypothetical protein  35.64 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3182  hypothetical protein  31.56 
 
 		 326 aa  122  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1469  hypothetical protein  39.46 
 
 		 326 aa  122  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  31.74 
 
 		 345 aa  122  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1459  hypothetical protein  32.75 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1209  hypothetical protein  33.24 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3257  hypothetical protein  31.29 
 
 		 316 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2399  putative signal peptide protein  31.52 
 
 		 346 aa  113  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  32.53 
 
 		 351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  28.29 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3233  hypothetical protein  29.64 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.294837  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  38.14 
 
 		 317 aa  106  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  34 
 
 		 334 aa  106  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5405  hypothetical protein  34.3 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.562328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1013  hypothetical protein  29.3 
 
 		 362 aa  97.4  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  27.89 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  29.74 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  30.86 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0395  regulatory protein  30.67 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  30.37 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  27.76 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0980  hypothetical protein  34.13 
 
 		 341 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.979605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  33.63 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 		 398 aa  46.2  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1986  hypothetical protein  27.97 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00012685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.47 
 
 		 399 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.83 
 
 		 399 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>