61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2719 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1697  hypothetical protein  99.02 
 
 
407 aa  789    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3114  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  702    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1477  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  702    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2587  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  702    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2719  hypothetical protein  100 
 
 
541 aa  1056    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2204  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  702    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2641  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  702    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.192728  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1886  hypothetical protein  91.44 
 
 
380 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5962  hypothetical protein  75.76 
 
 
358 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2133  hypothetical protein  76.03 
 
 
358 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.089753 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2115  hypothetical protein  75.76 
 
 
358 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0320662  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5421  hypothetical protein  76.58 
 
 
358 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1155  hypothetical protein  76.86 
 
 
358 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0968736  normal  0.0377322 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2025  hypothetical protein  75.48 
 
 
358 aa  501  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.604471 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2152  hypothetical protein  75.48 
 
 
358 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0374202  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1447  hypothetical protein  72.8 
 
 
364 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.944051 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1565  hypothetical protein  67.84 
 
 
372 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491571  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2568  hypothetical protein  66.32 
 
 
388 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133782  normal  0.0201135 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  42.3 
 
 
366 aa  253  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1116  putative signal peptide protein  43.4 
 
 
359 aa  243  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0385568  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1039  hypothetical protein  40.88 
 
 
372 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.306566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0959  conserved hypothetical signal peptide protein  40.78 
 
 
359 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279719  normal  0.0122892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1055  putative signal peptide protein  40.22 
 
 
359 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23362  normal  0.366612 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  30.23 
 
 
348 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2750  putative signal peptide protein  32.12 
 
 
309 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0488  hypothetical protein  37.19 
 
 
326 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  32.48 
 
 
356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1469  hypothetical protein  36.51 
 
 
326 aa  118  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2399  putative signal peptide protein  30.42 
 
 
346 aa  115  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  30.17 
 
 
345 aa  115  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1209  hypothetical protein  33.33 
 
 
322 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  37.19 
 
 
317 aa  111  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  35.26 
 
 
334 aa  110  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  30.68 
 
 
350 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3701  hypothetical protein  32.48 
 
 
318 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3233  hypothetical protein  29.25 
 
 
315 aa  107  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.294837  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3423  hypothetical protein  31.7 
 
 
318 aa  105  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  32.67 
 
 
351 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2757  hypothetical protein  31.08 
 
 
318 aa  102  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1459  hypothetical protein  30.75 
 
 
341 aa  101  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3182  hypothetical protein  31.65 
 
 
326 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1013  hypothetical protein  29.54 
 
 
362 aa  99.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5405  hypothetical protein  31.45 
 
 
332 aa  94.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.562328  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3257  hypothetical protein  28.37 
 
 
316 aa  92.8  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  26.73 
 
 
301 aa  92.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  29.33 
 
 
339 aa  86.3  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  32.93 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3116  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.669279  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2202  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0395  regulatory protein  28.09 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  28.09 
 
 
306 aa  67  0.0000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  31.51 
 
 
305 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0980  hypothetical protein  28.57 
 
 
341 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.979605  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.48 
 
 
399 aa  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.48 
 
 
399 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1986  hypothetical protein  29.77 
 
 
452 aa  49.3  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00012685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 
398 aa  47.8  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  33.09 
 
 
383 aa  47.4  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.38 
 
 
397 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 
399 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  26.28 
 
 
403 aa  45.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>