54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3701 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3701  hypothetical protein  100 
 
 
318 aa  619  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3423  hypothetical protein  70.4 
 
 
318 aa  413  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2757  hypothetical protein  69.91 
 
 
318 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3182  hypothetical protein  56.67 
 
 
326 aa  319  5e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5405  hypothetical protein  56.49 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.562328  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3233  hypothetical protein  49.5 
 
 
315 aa  278  9e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.294837  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3257  hypothetical protein  46.86 
 
 
316 aa  250  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1209  hypothetical protein  50.16 
 
 
322 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1013  hypothetical protein  43.43 
 
 
362 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2750  putative signal peptide protein  44.74 
 
 
309 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2399  putative signal peptide protein  41.12 
 
 
346 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1447  hypothetical protein  37.65 
 
 
364 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.944051 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5421  hypothetical protein  30.5 
 
 
358 aa  126  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5962  hypothetical protein  30.79 
 
 
358 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2115  hypothetical protein  30.79 
 
 
358 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0320662  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2133  hypothetical protein  30.5 
 
 
358 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.089753 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2025  hypothetical protein  36.77 
 
 
358 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.604471 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2152  hypothetical protein  36.77 
 
 
358 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0374202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1155  hypothetical protein  29.91 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0968736  normal  0.0377322 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1116  putative signal peptide protein  32.01 
 
 
359 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0385568  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2568  hypothetical protein  34.55 
 
 
388 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133782  normal  0.0201135 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1886  hypothetical protein  32.05 
 
 
380 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2641  hypothetical protein  32.48 
 
 
358 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.192728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2587  hypothetical protein  32.48 
 
 
358 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1477  hypothetical protein  32.48 
 
 
358 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3114  hypothetical protein  32.48 
 
 
358 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1697  hypothetical protein  32.48 
 
 
407 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2204  hypothetical protein  32.48 
 
 
358 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2719  hypothetical protein  32.48 
 
 
541 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0959  conserved hypothetical signal peptide protein  35.16 
 
 
359 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279719  normal  0.0122892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1565  hypothetical protein  33.74 
 
 
372 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491571  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1055  putative signal peptide protein  36.07 
 
 
359 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23362  normal  0.366612 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1039  hypothetical protein  32.04 
 
 
372 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.306566 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  28.57 
 
 
350 aa  88.6  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  37.41 
 
 
301 aa  88.2  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  30.73 
 
 
366 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  28.45 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1459  hypothetical protein  36.53 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  31.39 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  26.87 
 
 
351 aa  68.9  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0488  hypothetical protein  27.94 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1469  hypothetical protein  26.76 
 
 
326 aa  65.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  30.35 
 
 
305 aa  60.5  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0395  regulatory protein  34.24 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  34.24 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  36.56 
 
 
339 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  29.22 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  28.65 
 
 
345 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  32.14 
 
 
317 aa  50.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1986  hypothetical protein  28.17 
 
 
452 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00012685  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  31.85 
 
 
334 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1757  hypothetical protein  24.14 
 
 
381 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.870085  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  27.14 
 
 
402 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0980  hypothetical protein  45.1 
 
 
341 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.979605  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>