49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2399 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2399  putative signal peptide protein  100 
 
 		 346 aa  667    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2750  putative signal peptide protein  50.16 
 
 		 309 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1209  hypothetical protein  44.34 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3701  hypothetical protein  42.27 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3233  hypothetical protein  41.93 
 
 		 315 aa  192  9e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.294837  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3423  hypothetical protein  40.25 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5405  hypothetical protein  39.94 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.562328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3257  hypothetical protein  43.54 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3182  hypothetical protein  40.18 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2757  hypothetical protein  39.94 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1013  hypothetical protein  37.74 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1886  hypothetical protein  31.9 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1116  putative signal peptide protein  31.25 
 
 		 359 aa  122  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0385568  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2719  hypothetical protein  30.4 
 
 		 541 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1697  hypothetical protein  31.08 
 
 		 407 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1155  hypothetical protein  32.14 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0968736  normal  0.0377322 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1477  hypothetical protein  31.08 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2641  hypothetical protein  31.08 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.192728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2587  hypothetical protein  31.08 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2204  hypothetical protein  31.08 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3114  hypothetical protein  31.08 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21409  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2025  hypothetical protein  31.87 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.604471 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2133  hypothetical protein  31.87 
 
 		 358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.089753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2152  hypothetical protein  31.87 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0374202  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5962  hypothetical protein  31.59 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2115  hypothetical protein  31.59 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0320662  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1447  hypothetical protein  35.74 
 
 		 364 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.944051 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5421  hypothetical protein  31.32 
 
 		 358 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2568  hypothetical protein  34.94 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133782  normal  0.0201135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1565  hypothetical protein  30.7 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491571  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  31.33 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1039  hypothetical protein  30.68 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.306566 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0959  conserved hypothetical signal peptide protein  29.35 
 
 		 359 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279719  normal  0.0122892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1055  putative signal peptide protein  30.71 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23362  normal  0.366612 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0488  hypothetical protein  33.1 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1469  hypothetical protein  35 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  35.06 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  36.64 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  31.61 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  30.2 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  36.42 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1459  hypothetical protein  34.84 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  29.65 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  27.93 
 
 		 348 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  30.54 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  40 
 
 		 306 aa  54.7  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1986  hypothetical protein  28.83 
 
 		 452 aa  51.2  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00012685  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  38 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  34.55 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>