58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3233 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3233  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  635    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.294837  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3423  hypothetical protein  50 
 
 		 318 aa  279  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1209  hypothetical protein  52.22 
 
 		 322 aa  278  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3701  hypothetical protein  50.34 
 
 		 318 aa  275  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2757  hypothetical protein  50 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3182  hypothetical protein  51.39 
 
 		 326 aa  268  8e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3257  hypothetical protein  49.68 
 
 		 316 aa  263  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5405  hypothetical protein  50.18 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.562328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1013  hypothetical protein  46.57 
 
 		 362 aa  244  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2750  putative signal peptide protein  44.26 
 
 		 309 aa  225  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2399  putative signal peptide protein  41.43 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1565  hypothetical protein  29.62 
 
 		 372 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491571  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1447  hypothetical protein  33.78 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.944051 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2568  hypothetical protein  33.78 
 
 		 388 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133782  normal  0.0201135 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5421  hypothetical protein  29.55 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2152  hypothetical protein  28.7 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0374202  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2025  hypothetical protein  28.7 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.604471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1039  hypothetical protein  29.63 
 
 		 372 aa  106  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.306566 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1155  hypothetical protein  29.2 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0968736  normal  0.0377322 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1886  hypothetical protein  28.11 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2641  hypothetical protein  28.66 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.192728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2587  hypothetical protein  28.66 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3114  hypothetical protein  28.66 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1477  hypothetical protein  28.66 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2204  hypothetical protein  28.66 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1697  hypothetical protein  28.66 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1116  putative signal peptide protein  32.57 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0385568  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2133  hypothetical protein  28.66 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.089753 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2115  hypothetical protein  28.66 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0320662  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5962  hypothetical protein  28.66 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2719  hypothetical protein  28.66 
 
 		 541 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  28.97 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0959  conserved hypothetical signal peptide protein  33.79 
 
 		 359 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279719  normal  0.0122892 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0488  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1055  putative signal peptide protein  33.33 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23362  normal  0.366612 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1469  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  29.33 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  33.57 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1459  hypothetical protein  34.23 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  29.22 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  29.65 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  30.91 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  25.97 
 
 		 345 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  36.44 
 
 		 339 aa  67  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  34.59 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  31.89 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  32.05 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0395  regulatory protein  31.89 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  31.78 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  29.52 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1986  hypothetical protein  26.85 
 
 		 452 aa  56.2  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00012685  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.47 
 
 		 398 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.71 
 
 		 399 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.45 
 
 		 393 aa  46.2  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.83 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  26.21 
 
 		 383 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.96 
 
 		 393 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  23.28 
 
 		 402 aa  42.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>