43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1986 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1986  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  922    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00012685  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1459  hypothetical protein  34.81 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  80.56 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3182  hypothetical protein  29.19 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  27.27 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1039  hypothetical protein  32.56 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.306566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1209  hypothetical protein  32.32 
 
 		 322 aa  57  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3257  hypothetical protein  34.09 
 
 		 316 aa  56.6  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3233  hypothetical protein  26.85 
 
 		 315 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.294837  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  34.65 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  32.03 
 
 		 339 aa  54.7  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3423  hypothetical protein  29.45 
 
 		 318 aa  53.9  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1886  hypothetical protein  30.53 
 
 		 380 aa  53.5  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  30.71 
 
 		 345 aa  53.1  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  28.86 
 
 		 348 aa  52.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2757  hypothetical protein  29.63 
 
 		 318 aa  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2399  putative signal peptide protein  29.65 
 
 		 346 aa  51.6  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1013  hypothetical protein  28.39 
 
 		 362 aa  51.2  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.0678834 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1116  putative signal peptide protein  24.37 
 
 		 359 aa  50.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0385568  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1697  hypothetical protein  29.77 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1477  hypothetical protein  29.77 
 
 		 358 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2641  hypothetical protein  29.77 
 
 		 358 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.192728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2587  hypothetical protein  29.77 
 
 		 358 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3114  hypothetical protein  29.77 
 
 		 358 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2719  hypothetical protein  29.77 
 
 		 541 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2204  hypothetical protein  29.77 
 
 		 358 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3701  hypothetical protein  27.05 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  48.5  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  29.89 
 
 		 317 aa  47.8  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1055  putative signal peptide protein  27.94 
 
 		 359 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23362  normal  0.366612 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0959  conserved hypothetical signal peptide protein  27.94 
 
 		 359 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279719  normal  0.0122892 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0488  hypothetical protein  28.48 
 
 		 326 aa  47.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.47 
 
 		 398 aa  46.6  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  31.5 
 
 		 351 aa  46.6  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  32.56 
 
 		 306 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1565  hypothetical protein  24.69 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491571  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2152  hypothetical protein  27.97 
 
 		 358 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0374202  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2025  hypothetical protein  27.97 
 
 		 358 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.604471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2568  hypothetical protein  27.34 
 
 		 388 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133782  normal  0.0201135 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  45.24 
 
 		 334 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2133  hypothetical protein  27.27 
 
 		 358 aa  43.5  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.089753 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5962  hypothetical protein  27.27 
 
 		 358 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2115  hypothetical protein  27.27 
 
 		 358 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0320662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>