25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0221 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  785    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  30.58 
 
 
326 aa  142  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  30.43 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  32.76 
 
 
330 aa  113  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  25 
 
 
297 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  29.32 
 
 
336 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  30.1 
 
 
354 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  30.56 
 
 
353 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  26.8 
 
 
311 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  30.58 
 
 
373 aa  90.5  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  29 
 
 
317 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  26.25 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  28.76 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  25.52 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0275  hypothetical protein  33.09 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  28 
 
 
269 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  25.59 
 
 
319 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1986  hypothetical protein  80.56 
 
 
452 aa  63.5  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00012685  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  25.34 
 
 
298 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  28.9 
 
 
349 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  24.03 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1343  hypothetical protein  30 
 
 
301 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  31.25 
 
 
286 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  20.46 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  24.08 
 
 
275 aa  43.1  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>