31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8884 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  667    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  68.8 
 
 		 373 aa  354  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  48.36 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  45.83 
 
 		 354 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  43.4 
 
 		 353 aa  228  9e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  38.75 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  34.18 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  29.39 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  28.51 
 
 		 307 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  32.92 
 
 		 311 aa  96.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  30.03 
 
 		 385 aa  96.3  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  29.51 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  30.66 
 
 		 326 aa  89.7  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  26.72 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  26.24 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  30.3 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  23.13 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  29.22 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1435  hypothetical protein  31.1 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327488  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  27.65 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  24.91 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  28.8 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  27.35 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0275  hypothetical protein  32.14 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1408  hypothetical protein  28.94 
 
 		 544 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194543 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  20.68 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13188  hypothetical protein  22.43 
 
 		 286 aa  52.8  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1450  hypothetical protein  27.97 
 
 		 539 aa  50.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265665  normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  20 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  25.63 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  20.34 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>