27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4930 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13188  hypothetical protein  41.61 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  42.4 
 
 
315 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  42.69 
 
 
319 aa  209  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  39.86 
 
 
361 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  37.35 
 
 
319 aa  139  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  34.28 
 
 
269 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  28.92 
 
 
298 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0275  hypothetical protein  31.87 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4995  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  91.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185737  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  25 
 
 
373 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  24.44 
 
 
297 aa  79  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  23.62 
 
 
349 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  22.64 
 
 
336 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  21.05 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1343  hypothetical protein  29.38 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00462  hypothetical protein  38.3 
 
 
276 aa  63.5  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  25.11 
 
 
293 aa  60.1  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  25.64 
 
 
307 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  23.29 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  29.38 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  23.74 
 
 
326 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  31.25 
 
 
385 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  20.61 
 
 
275 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  20.64 
 
 
330 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  25.13 
 
 
480 aa  46.2  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  28.48 
 
 
441 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>