25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0221 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  741    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  59.56 
 
 		 319 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  60.9 
 
 		 315 aa  378  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  39.86 
 
 		 286 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13188  hypothetical protein  39.22 
 
 		 286 aa  170  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  31.58 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  31.08 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  30.1 
 
 		 269 aa  96.3  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4995  hypothetical protein  34.58 
 
 		 323 aa  95.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1343  hypothetical protein  30.23 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  23.26 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  24.91 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  24.32 
 
 		 349 aa  66.6  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00462  hypothetical protein  31.01 
 
 		 276 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  22.61 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  30.36 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  27.36 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  23.64 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0275  hypothetical protein  26.98 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  18.59 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  25.12 
 
 		 293 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  20 
 
 		 336 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  21.54 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  22.52 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  22.09 
 
 		 334 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>