24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0275 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0275  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  605  9.999999999999999e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  32.58 
 
 
269 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  32.11 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  29.23 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13188  hypothetical protein  24.7 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  28.35 
 
 
298 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1343  hypothetical protein  27.27 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4995  hypothetical protein  32.24 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185737  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  40.24 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  33.09 
 
 
385 aa  66.6  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00462  hypothetical protein  25.95 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  33.55 
 
 
319 aa  66.6  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  23.4 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  24.63 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  26.98 
 
 
361 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  32.14 
 
 
336 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  32.1 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  34.44 
 
 
373 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  31.76 
 
 
326 aa  49.7  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  21.74 
 
 
317 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  32.93 
 
 
354 aa  47  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  21.15 
 
 
307 aa  45.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  22.55 
 
 
353 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  25.88 
 
 
297 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>