25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01102 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  646    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  60.9 
 
 		 361 aa  378  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  58.18 
 
 		 319 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  42.4 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13188  hypothetical protein  41.5 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  34.4 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  30.52 
 
 		 319 aa  109  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  31.18 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4995  hypothetical protein  32.17 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185737  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  22.53 
 
 		 373 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00462  hypothetical protein  28.29 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  24.73 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  25.51 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1343  hypothetical protein  29.66 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  27.2 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  23.32 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  25.99 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0275  hypothetical protein  24.63 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  23.62 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  22.48 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  26.4 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  24.71 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  20.68 
 
 		 336 aa  53.1  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  21.15 
 
 		 326 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  20.46 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>