34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3279 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  718    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  63.96 
 
 		 336 aa  356  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  53.2 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  52.86 
 
 		 354 aa  251  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  48.02 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  38.61 
 
 		 324 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  32.38 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  31.78 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  32.62 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  30.65 
 
 		 297 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  29.76 
 
 		 326 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  35.88 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  29.72 
 
 		 326 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  30.58 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  27.05 
 
 		 326 aa  90.1  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  25 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1435  hypothetical protein  34.04 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327488  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  22.73 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  23.81 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  27.59 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  29.97 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  27.16 
 
 		 269 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1450  hypothetical protein  31.11 
 
 		 539 aa  67  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265665  normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1408  hypothetical protein  31.88 
 
 		 544 aa  66.2  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194543 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  21.55 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  22.61 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  28.36 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13188  hypothetical protein  22.08 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  30.08 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0275  hypothetical protein  28.57 
 
 		 288 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1343  hypothetical protein  27.05 
 
 		 301 aa  53.5  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00462  hypothetical protein  29.13 
 
 		 276 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  43.06 
 
 		 1097 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>