33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1179 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  100 
 
 		 297 aa  610  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  45.79 
 
 		 293 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  45.99 
 
 		 317 aa  254  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  46.13 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  37.91 
 
 		 326 aa  185  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  36.76 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  30.61 
 
 		 330 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  30.08 
 
 		 373 aa  109  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  30.8 
 
 		 326 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  25 
 
 		 385 aa  99  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  27.45 
 
 		 326 aa  97.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  32.21 
 
 		 269 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  26.72 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  29.69 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  29.08 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  24.44 
 
 		 286 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  30.17 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  27.97 
 
 		 354 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  25.51 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  28.41 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  28.07 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  24.55 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  24.7 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  23.64 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  23.44 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1435  hypothetical protein  27.64 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327488  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  28.39 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13188  hypothetical protein  24.9 
 
 		 286 aa  54.3  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1450  hypothetical protein  27.45 
 
 		 539 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265665  normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1408  hypothetical protein  27.8 
 
 		 544 aa  52.8  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4995  hypothetical protein  27.06 
 
 		 323 aa  48.9  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185737  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00462  hypothetical protein  22.74 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0275  hypothetical protein  25.88 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>