19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4995 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4995  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  653    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185737  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13188  hypothetical protein  32.4 
 
 
286 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  34.58 
 
 
361 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  30.03 
 
 
319 aa  93.2  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  31.68 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  34.63 
 
 
269 aa  89.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  32.17 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  32.17 
 
 
319 aa  87.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00462  hypothetical protein  28.52 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0275  hypothetical protein  32.24 
 
 
288 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1343  hypothetical protein  26.25 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  29.48 
 
 
311 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  29.61 
 
 
326 aa  57  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  25.31 
 
 
354 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  25.91 
 
 
307 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  28.29 
 
 
293 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  27.06 
 
 
297 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  25.48 
 
 
317 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>