33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3579 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  100 
 
 		 326 aa  672    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  41.44 
 
 		 326 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  30.58 
 
 		 385 aa  142  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  30.18 
 
 		 311 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  30.53 
 
 		 330 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  27.45 
 
 		 297 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  29.47 
 
 		 353 aa  96.3  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  29.45 
 
 		 307 aa  95.9  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  29.58 
 
 		 293 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  28.1 
 
 		 317 aa  93.6  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  28.1 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  27.05 
 
 		 373 aa  89.7  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  27.3 
 
 		 354 aa  87.8  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  26.24 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  24.83 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  27.34 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1435  hypothetical protein  27.5 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327488  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  25.26 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  24.91 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  25.71 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  25.99 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  33.01 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  27.41 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4995  hypothetical protein  29.61 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185737  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  27.78 
 
 		 480 aa  56.6  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  25.45 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13188  hypothetical protein  24.03 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  23.74 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0275  hypothetical protein  31.76 
 
 		 288 aa  49.7  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00462  hypothetical protein  30.17 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1450  hypothetical protein  27.8 
 
 		 539 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265665  normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  27.52 
 
 		 269 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1343  hypothetical protein  21.62 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>