34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1731 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  639    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  41.67 
 
 		 307 aa  178  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  35.49 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  36.26 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  37.15 
 
 		 293 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  36.43 
 
 		 297 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  33.74 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  33.66 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  35.1 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  33.33 
 
 		 373 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  30.18 
 
 		 326 aa  112  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  32.92 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  33.06 
 
 		 336 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  26.8 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  29.72 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  30.38 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  27.56 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  28.51 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  28.12 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  26.8 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  23.28 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  23.32 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  24.79 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  22.01 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4995  hypothetical protein  29.48 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185737  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13188  hypothetical protein  23.02 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1450  hypothetical protein  24.36 
 
 		 539 aa  56.2  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265665  normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1408  hypothetical protein  23.91 
 
 		 544 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0275  hypothetical protein  32.1 
 
 		 288 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1435  hypothetical protein  26.18 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  29.38 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1343  hypothetical protein  26.62 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  24.73 
 
 		 480 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00462  hypothetical protein  34.21 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>