19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1450 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1450  hypothetical protein  100 
 
 		 539 aa  1031    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265665  normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1408  hypothetical protein  70.96 
 
 		 544 aa  634  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  35.87 
 
 		 480 aa  167  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  41.78 
 
 		 349 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1435  hypothetical protein  42.11 
 
 		 362 aa  150  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327488  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  40.86 
 
 		 334 aa  126  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  30 
 
 		 373 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  27.21 
 
 		 307 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  27.24 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  26.84 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  26.71 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  28.16 
 
 		 293 aa  53.5  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  27.51 
 
 		 326 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  24.36 
 
 		 311 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  31.8 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  26.47 
 
 		 297 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  30.61 
 
 		 275 aa  51.6  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  27.33 
 
 		 336 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  27.8 
 
 		 326 aa  47  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>