23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3903 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  630  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  50.36 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1435  hypothetical protein  51.55 
 
 		 362 aa  218  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327488  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  39.22 
 
 		 480 aa  178  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1450  hypothetical protein  40 
 
 		 539 aa  135  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265665  normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1408  hypothetical protein  37.84 
 
 		 544 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  33.92 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  31.18 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  27.22 
 
 		 330 aa  90.1  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  33.57 
 
 		 354 aa  85.9  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  32.71 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  29.05 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  23.98 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  26.13 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  24.7 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  27.72 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  29.01 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  27.62 
 
 		 293 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  22.09 
 
 		 361 aa  49.7  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  22.17 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  25.51 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  31.55 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  27.34 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>