25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4563 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  100 
 
 
480 aa  966    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  43.82 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1435  hypothetical protein  42.19 
 
 
362 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327488  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1408  hypothetical protein  36.86 
 
 
544 aa  163  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000194543 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  40.31 
 
 
349 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1450  hypothetical protein  37.11 
 
 
539 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265665  normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  31.52 
 
 
324 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  27.43 
 
 
330 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  29.26 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  26.64 
 
 
373 aa  75.1  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  24.55 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  27.76 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  26.21 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  27.65 
 
 
293 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  29.44 
 
 
307 aa  63.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  27.98 
 
 
269 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  25.26 
 
 
326 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  27.78 
 
 
326 aa  57  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  27.08 
 
 
326 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  27.19 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  25.52 
 
 
275 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13188  hypothetical protein  23.31 
 
 
286 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  24.82 
 
 
311 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  25.13 
 
 
286 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  21.48 
 
 
315 aa  43.5  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>