27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4173 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  690    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  54.29 
 
 		 354 aa  295  8e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  42.76 
 
 		 330 aa  233  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  45.96 
 
 		 336 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  48.02 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  36.77 
 
 		 324 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  35.1 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  32.1 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  29.47 
 
 		 326 aa  96.7  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  34.44 
 
 		 349 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  28.3 
 
 		 385 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  27.57 
 
 		 326 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  32.79 
 
 		 293 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  30.29 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  29.08 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  29.36 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  33.67 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  33.46 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1435  hypothetical protein  31.4 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327488  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  29.2 
 
 		 298 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1450  hypothetical protein  34.18 
 
 		 539 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265665  normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  28.21 
 
 		 269 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1408  hypothetical protein  33.33 
 
 		 544 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194543 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  25.33 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  31.1 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  29.55 
 
 		 1242 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0275  hypothetical protein  22.65 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>