31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0830 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  658    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  55.02 
 
 
373 aa  280  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  50.16 
 
 
336 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  50.72 
 
 
354 aa  259  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  46.59 
 
 
353 aa  232  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  37.37 
 
 
324 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  33.33 
 
 
311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  34.02 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  31.87 
 
 
317 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  34.62 
 
 
293 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  30.83 
 
 
326 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  32.76 
 
 
385 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  30.61 
 
 
297 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  32.84 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  30.53 
 
 
326 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  32.07 
 
 
349 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  28.4 
 
 
334 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  26.16 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  25.82 
 
 
480 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0275  hypothetical protein  40.24 
 
 
288 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  29.1 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1435  hypothetical protein  29.64 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327488  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  27.46 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  22.15 
 
 
319 aa  64.3  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1450  hypothetical protein  26.84 
 
 
539 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265665  normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  30.36 
 
 
361 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  28.06 
 
 
275 aa  60.1  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  23.62 
 
 
315 aa  59.3  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1408  hypothetical protein  25.5 
 
 
544 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000194543 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1343  hypothetical protein  27.86 
 
 
301 aa  52.8  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  20.64 
 
 
286 aa  46.6  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>