34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4607 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  100 
 
 		 307 aa  627  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  46.13 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  47.43 
 
 		 317 aa  251  9.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  43.54 
 
 		 293 aa  241  9e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  42.47 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  41.67 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  34.02 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  32.24 
 
 		 373 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  31.94 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  32.51 
 
 		 353 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  28.51 
 
 		 336 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  29.45 
 
 		 326 aa  95.9  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  33.06 
 
 		 354 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  26.87 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  28.05 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  26.25 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  29.53 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  29.44 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1450  hypothetical protein  27.21 
 
 		 539 aa  62.4  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265665  normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  22.48 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  26.8 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1408  hypothetical protein  26.97 
 
 		 544 aa  56.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  29.29 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  25.64 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  27.72 
 
 		 334 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1435  hypothetical protein  30.77 
 
 		 362 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327488  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  27.67 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13188  hypothetical protein  25.85 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  31.61 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4995  hypothetical protein  28.33 
 
 		 323 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  21.54 
 
 		 361 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0275  hypothetical protein  21.15 
 
 		 288 aa  45.8  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1343  hypothetical protein  23.24 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00462  hypothetical protein  22.26 
 
 		 276 aa  43.5  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>