26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13188 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_13188  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  583  1e-166  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  41.61 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  41.5 
 
 
315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  39.31 
 
 
319 aa  193  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  39.22 
 
 
361 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  35.27 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  31.28 
 
 
298 aa  112  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  30.19 
 
 
269 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4995  hypothetical protein  32.4 
 
 
323 aa  105  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1343  hypothetical protein  30.77 
 
 
301 aa  82  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0275  hypothetical protein  24.7 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  22.06 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00462  hypothetical protein  26.79 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  22.08 
 
 
373 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  23.02 
 
 
311 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  24.03 
 
 
326 aa  56.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  24.12 
 
 
349 aa  56.2  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  23.92 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  25.85 
 
 
307 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  24.9 
 
 
297 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  22.43 
 
 
336 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  22.36 
 
 
293 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  23.92 
 
 
480 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  22.56 
 
 
385 aa  43.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  21.19 
 
 
330 aa  42.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  25.54 
 
 
317 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>