29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1211 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  621  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  47.33 
 
 
319 aa  253  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  34.01 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  34.4 
 
 
315 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  28.92 
 
 
286 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  31.58 
 
 
361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13188  hypothetical protein  31.28 
 
 
286 aa  112  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  31.12 
 
 
269 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4995  hypothetical protein  31.68 
 
 
323 aa  92.4  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185737  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0275  hypothetical protein  28.35 
 
 
288 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  28.04 
 
 
326 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1343  hypothetical protein  28.57 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  31.02 
 
 
354 aa  72.4  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00462  hypothetical protein  27.23 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  29.69 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  28.07 
 
 
297 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  29.2 
 
 
353 aa  69.3  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  29.1 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  28.36 
 
 
373 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  30 
 
 
317 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  26.72 
 
 
349 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  25.34 
 
 
385 aa  60.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  24.91 
 
 
336 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  27.41 
 
 
326 aa  56.6  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  26.14 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  26.78 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  31.61 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  25.51 
 
 
334 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  26.01 
 
 
324 aa  43.5  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>