29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0244 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  702    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  54.09 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  50.72 
 
 		 330 aa  272  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  52.56 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  46.03 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  39.5 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  32.92 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  32.48 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  32 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  31.38 
 
 		 293 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  33.07 
 
 		 326 aa  96.3  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  27.96 
 
 		 326 aa  94.4  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 317 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  33.58 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  30.31 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  28.68 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  27.97 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  31.15 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  24.86 
 
 		 480 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  27.27 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1435  hypothetical protein  30.14 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4995  hypothetical protein  24.02 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185737  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1408  hypothetical protein  26.62 
 
 		 544 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194543 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  32.89 
 
 		 275 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0275  hypothetical protein  25.68 
 
 		 288 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  22.19 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1450  hypothetical protein  28.57 
 
 		 539 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265665  normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  25.62 
 
 		 361 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  27.2 
 
 		 269 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>