24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0727 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  637    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  36.86 
 
 		 353 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  38.35 
 
 		 373 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  38.41 
 
 		 336 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  37.37 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  39.5 
 
 		 354 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1435  hypothetical protein  34.42 
 
 		 362 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327488  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  29.93 
 
 		 349 aa  90.1  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  32.4 
 
 		 334 aa  86.7  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  31.52 
 
 		 480 aa  86.3  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  30.38 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  31.63 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  28.41 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  27.27 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  26.06 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  30.57 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1450  hypothetical protein  27.2 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265665  normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  25.78 
 
 		 269 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  29.29 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  28.39 
 
 		 297 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1408  hypothetical protein  26.85 
 
 		 544 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194543 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00462  hypothetical protein  31.65 
 
 		 276 aa  46.2  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  28.4 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  26.01 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>