31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6783 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  100 
 
 		 293 aa  595  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  68.66 
 
 		 317 aa  398  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  45.79 
 
 		 297 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  43.54 
 
 		 307 aa  241  7.999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  43.3 
 
 		 326 aa  202  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  37.15 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  34.62 
 
 		 330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  34.18 
 
 		 336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  32.62 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  29.69 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  29.58 
 
 		 326 aa  93.6  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  33.47 
 
 		 354 aa  92  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  33.2 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  32.2 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  28.76 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  31.94 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  31.3 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  28.29 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  26.39 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  27.65 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1435  hypothetical protein  32.2 
 
 		 362 aa  62.4  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  25.11 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1408  hypothetical protein  27.94 
 
 		 544 aa  55.8  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194543 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  24.71 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  26.14 
 
 		 298 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1450  hypothetical protein  27.14 
 
 		 539 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265665  normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  25.12 
 
 		 361 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  21.43 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  28.99 
 
 		 334 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4995  hypothetical protein  28.29 
 
 		 323 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185737  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13188  hypothetical protein  22.36 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>