28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4012 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  566  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  34.28 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0275  hypothetical protein  32.58 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13188  hypothetical protein  30.19 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  31.18 
 
 		 315 aa  108  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  32.41 
 
 		 319 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  31.12 
 
 		 298 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  30.1 
 
 		 361 aa  96.3  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  30.86 
 
 		 319 aa  90.1  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4995  hypothetical protein  34.63 
 
 		 323 aa  89.7  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185737  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  32.21 
 
 		 297 aa  89  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  33.51 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  26.16 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  28.51 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  31.3 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1343  hypothetical protein  28.38 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  27.16 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  25.48 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  29.53 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  28 
 
 		 385 aa  65.5  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00462  hypothetical protein  35 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  27.98 
 
 		 480 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  25.75 
 
 		 349 aa  57  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  28.21 
 
 		 353 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  25.78 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  25.39 
 
 		 326 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  25.63 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  27.52 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>