31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27600 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  679    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1435  hypothetical protein  63.71 
 
 		 362 aa  289  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327488  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  52.89 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  40.32 
 
 		 480 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1408  hypothetical protein  39.22 
 
 		 544 aa  159  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1450  hypothetical protein  41.78 
 
 		 539 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265665  normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  36.15 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  32.07 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  34.44 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  29.93 
 
 		 324 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  30.3 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  31.36 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  32.33 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  28.05 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  30.58 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  26.8 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  23.62 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  27.05 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  27.2 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  28.29 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  24.32 
 
 		 361 aa  67  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  26.49 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  30.62 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  26.32 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  25 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  28.9 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  25.75 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  27.87 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13188  hypothetical protein  24.12 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  24.06 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1343  hypothetical protein  34.52 
 
 		 301 aa  42.7  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>