21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1343 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1343  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  618  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00462  hypothetical protein  40.23 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13188  hypothetical protein  30.77 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  30.84 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0275  hypothetical protein  27.27 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  28.38 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4995  hypothetical protein  26.25 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  30.23 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  29.66 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  32.64 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4930  hypothetical protein  29.38 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  26.95 
 
 		 326 aa  57  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  27.86 
 
 		 330 aa  52.8  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  27.05 
 
 		 373 aa  52.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  26.62 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  30 
 
 		 385 aa  49.3  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  23.24 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  35.82 
 
 		 317 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  21.62 
 
 		 326 aa  42.7  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  34.52 
 
 		 349 aa  42.7  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>