28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2886 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  672    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  43.3 
 
 		 293 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  42.47 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  41.04 
 
 		 317 aa  192  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  37.91 
 
 		 297 aa  185  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  36.26 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  30.83 
 
 		 330 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  29.76 
 
 		 373 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  33.21 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  29.51 
 
 		 336 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  28.17 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  33.07 
 
 		 354 aa  92.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  28.1 
 
 		 326 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  26.29 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0221  hypothetical protein  25.52 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0103897  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  27.27 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  26.49 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  25.26 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0927  hypothetical protein  25.25 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1408  hypothetical protein  28.25 
 
 		 544 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1450  hypothetical protein  27.51 
 
 		 539 aa  57.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265665  normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1435  hypothetical protein  25.29 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327488  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1211  hypothetical protein  26.78 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.408504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13188  hypothetical protein  23.92 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4012  hypothetical protein  25.39 
 
 		 269 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00869755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01102  hypothetical protein  21.15 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1361  hypothetical protein  21.13 
 
 		 319 aa  49.3  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0863343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0221  hypothetical protein  22.52 
 
 		 361 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>