18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1408 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1408  hypothetical protein  100 
 
 		 544 aa  1046    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194543 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1450  hypothetical protein  74.66 
 
 		 539 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265665  normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  37.14 
 
 		 480 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  40.98 
 
 		 349 aa  157  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1435  hypothetical protein  41.28 
 
 		 362 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327488  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  37.25 
 
 		 334 aa  120  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  31.94 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  29.76 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  28.99 
 
 		 293 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  29.43 
 
 		 336 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  28.25 
 
 		 326 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  25.5 
 
 		 330 aa  53.5  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  23.91 
 
 		 311 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  27.01 
 
 		 307 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  33.33 
 
 		 353 aa  52  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  27.32 
 
 		 297 aa  50.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  29.44 
 
 		 275 aa  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  26.85 
 
 		 324 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>