22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1435 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1435  hypothetical protein  100 
 
 		 362 aa  690    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327488  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27600  hypothetical protein  60.69 
 
 		 349 aa  291  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3903  hypothetical protein  53.78 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4563  hypothetical protein  36.75 
 
 		 480 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.658423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1450  hypothetical protein  40.66 
 
 		 539 aa  155  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.265665  normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1408  hypothetical protein  40.71 
 
 		 544 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0727  hypothetical protein  34.42 
 
 		 324 aa  99.4  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3279  hypothetical protein  32.13 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.154613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4173  hypothetical protein  31.4 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3579  putative integral membrane protein  27.5 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.918432  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0830  hypothetical protein  29.02 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8884  hypothetical protein  29.69 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156252  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6783  putative lipoprotein  32.2 
 
 		 293 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.810723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0244  hypothetical protein  30.72 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1731  hypothetical protein  26.18 
 
 		 311 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2886  hypothetical protein  25.29 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3022  hypothetical protein  28.73 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1179  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4607  PE-PGRS family protein  30.77 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6753  putative lipoprotein  31.9 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0699  putative lipoprotein  28.84 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2520  hypothetical protein  30.77 
 
 		 808 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.432249  normal  0.0659168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>