38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0980 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0980  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  660    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.979605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1565  hypothetical protein  27.8 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491571  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  31.68 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5421  hypothetical protein  31.62 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  26.84 
 
 		 366 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1039  hypothetical protein  27.79 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.306566 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  28.78 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1886  hypothetical protein  29.37 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283934  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2133  hypothetical protein  30.97 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.089753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2568  hypothetical protein  30.95 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133782  normal  0.0201135 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1447  hypothetical protein  31.55 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.944051 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5962  hypothetical protein  30.97 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2152  hypothetical protein  31.42 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0374202  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2115  hypothetical protein  30.97 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0320662  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2025  hypothetical protein  31.42 
 
 		 358 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.604471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  28.41 
 
 		 356 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2204  hypothetical protein  28.57 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1477  hypothetical protein  28.57 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2641  hypothetical protein  28.57 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.192728  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2587  hypothetical protein  28.57 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3114  hypothetical protein  28.57 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1697  hypothetical protein  28.57 
 
 		 407 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  27.18 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2719  hypothetical protein  28.57 
 
 		 541 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1155  hypothetical protein  30.7 
 
 		 358 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0968736  normal  0.0377322 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1116  putative signal peptide protein  30.33 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0385568  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1055  putative signal peptide protein  30.59 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23362  normal  0.366612 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0959  conserved hypothetical signal peptide protein  28.57 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.279719  normal  0.0122892 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3257  hypothetical protein  31.62 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2066  hypothetical protein  25.64 
 
 		 301 aa  46.6  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3182  hypothetical protein  39.22 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  31.65 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  32.04 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  25.89 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  25.41 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  32.22 
 
 		 317 aa  43.5  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.43 
 
 		 398 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3701  hypothetical protein  45.1 
 
 		 318 aa  43.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>