92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0773 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  100 
 
 		 402 aa  825    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  52.97 
 
 		 401 aa  428  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  53.22 
 
 		 401 aa  430  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  54.29 
 
 		 401 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  53.81 
 
 		 395 aa  426  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  53.28 
 
 		 401 aa  426  1e-118  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  52.97 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  52.74 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  52.23 
 
 		 403 aa  404  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  52.75 
 
 		 403 aa  398  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  51.72 
 
 		 409 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  48.13 
 
 		 409 aa  381  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  47.52 
 
 		 409 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  47.26 
 
 		 408 aa  366  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  38.29 
 
 		 411 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  37.71 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  37.16 
 
 		 419 aa  223  6e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  38.78 
 
 		 411 aa  223  6e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  36.54 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.8 
 
 		 406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.8 
 
 		 406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.15 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 413 aa  209  8e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  36.97 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.68 
 
 		 411 aa  206  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.78 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.76 
 
 		 406 aa  202  8e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.45 
 
 		 421 aa  176  6e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  31.04 
 
 		 428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.28 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.43 
 
 		 426 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.12 
 
 		 432 aa  163  6e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.39 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  30.75 
 
 		 426 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  29.95 
 
 		 392 aa  159  6e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 		 399 aa  153  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 393 aa  149  7e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.77 
 
 		 398 aa  146  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.44 
 
 		 426 aa  144  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 401 aa  143  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  30.38 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  29.67 
 
 		 383 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 398 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.69 
 
 		 385 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  29.86 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.12 
 
 		 399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 397 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  30.83 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  29.9 
 
 		 384 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  26.76 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.38 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  28.72 
 
 		 403 aa  127  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  27.74 
 
 		 405 aa  126  7e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  27.02 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  29.27 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.62 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 401 aa  122  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.59 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  25.52 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  26.91 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  26.28 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  26.43 
 
 		 392 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  26.45 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  25.83 
 
 		 428 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  42.73 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  24.23 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  37.5 
 
 		 511 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  32.58 
 
 		 516 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16361  phosphoglyceromutase  31.87 
 
 		 540 aa  46.6  0.0009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2016  phosphoglyceromutase  28.89 
 
 		 515 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0100245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4527  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  29.25 
 
 		 515 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0891  phosphoglyceromutase  27.27 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16241  phosphoglyceromutase  27.78 
 
 		 540 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  28.41 
 
 		 513 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12103  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 506 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208635  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  28.4 
 
 		 512 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1527  phosphoglyceromutase  30.77 
 
 		 540 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18341  phosphoglyceromutase  31.11 
 
 		 542 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4716  phosphoglyceromutase  29.89 
 
 		 511 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000025941  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0173  phosphoglyceromutase  26 
 
 		 502 aa  42.7  0.01  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  26.25 
 
 		 509 aa  42.7  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>