78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2948 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 403 aa  795    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  53.35 
 
 		 403 aa  420  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  50.62 
 
 		 401 aa  410  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  52.38 
 
 		 395 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  51 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  49.38 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  50.75 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  52.75 
 
 		 402 aa  398  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  49.26 
 
 		 409 aa  382  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  47.88 
 
 		 401 aa  383  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  49.75 
 
 		 402 aa  383  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  50.12 
 
 		 409 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  50.36 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  51.72 
 
 		 409 aa  362  4e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 		 413 aa  245  9.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  36.32 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  36.71 
 
 		 414 aa  233  5e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.68 
 
 		 411 aa  229  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 		 411 aa  224  3e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 411 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  37.41 
 
 		 419 aa  223  6e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 		 411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 		 406 aa  216  5e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 411 aa  216  7e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.63 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 		 406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  40.7 
 
 		 429 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  35.05 
 
 		 406 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 		 406 aa  209  9e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.44 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  37.83 
 
 		 426 aa  189  5e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.8 
 
 		 421 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.44 
 
 		 426 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  33.07 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  30.71 
 
 		 387 aa  159  9e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.64 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 426 aa  156  6e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.2 
 
 		 401 aa  156  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 398 aa  155  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  33.5 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 399 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.5 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.32 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 398 aa  149  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.83 
 
 		 426 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  33.7 
 
 		 405 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.21 
 
 		 385 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  31.02 
 
 		 392 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.81 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 397 aa  145  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  28.54 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  32.06 
 
 		 383 aa  144  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 404 aa  143  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.58 
 
 		 398 aa  142  9e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  28.22 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 		 399 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 402 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  31.57 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.79 
 
 		 401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  30.18 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 		 399 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  29.4 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  31.2 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.8 
 
 		 399 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  29.93 
 
 		 402 aa  126  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  28.11 
 
 		 392 aa  110  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.17 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  25.12 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  27.53 
 
 		 428 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  27.01 
 
 		 428 aa  94  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  26.35 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  43.59 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  28.53 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0175  metalloenzyme domain protein  26.51 
 
 		 297 aa  42.7  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>