91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0860 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0860  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  100 
 
 
398 aa  804    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  60.35 
 
 
401 aa  513  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  54.4 
 
 
399 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1428  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  53.5 
 
 
399 aa  435  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.697984  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  53.12 
 
 
397 aa  425  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  52.41 
 
 
392 aa  427  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  53.48 
 
 
401 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2331  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  53.38 
 
 
399 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1879  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  53.38 
 
 
399 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  54.25 
 
 
399 aa  418  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0776  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  50.5 
 
 
398 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00516365  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0447  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  52.03 
 
 
385 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  50.5 
 
 
405 aa  395  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1292  phosphoglycerate mutase  48.96 
 
 
402 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1301  phosphoglycerate mutase  45.68 
 
 
404 aa  392  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2140  proposed homoserine kinase  47.42 
 
 
403 aa  390  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  49.63 
 
 
407 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0702  proposed homoserine kinase  49.49 
 
 
384 aa  381  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.350823  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1375  proposed homoserine kinase  48.89 
 
 
402 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0348409  decreased coverage  0.00000000388433 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  49.37 
 
 
387 aa  374  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  47.92 
 
 
397 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2019  proposed homoserine kinase  50.52 
 
 
383 aa  363  2e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.734369  normal  0.229701 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0678  proposed homoserine kinase  49.49 
 
 
383 aa  362  7.0000000000000005e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469269  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1517  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  44.61 
 
 
393 aa  348  6e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000830459  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0182  proposed homoserine kinase  45.54 
 
 
402 aa  346  4e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.213928  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1380  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  43.36 
 
 
393 aa  343  2e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000857382  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1635  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  44.11 
 
 
393 aa  342  7e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0256807  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3387  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  44.08 
 
 
396 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0308  proposed homoserine kinase  43.92 
 
 
402 aa  316  4e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1930  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  42.29 
 
 
398 aa  301  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1394  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.31 
 
 
414 aa  231  2e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0425  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  35.4 
 
 
411 aa  225  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.7315  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2656  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  34.89 
 
 
411 aa  223  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467628  normal  0.928465 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0750  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 
406 aa  216  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0182  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 
406 aa  210  4e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0684  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 
406 aa  202  8e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.874512 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1101  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.99 
 
 
409 aa  200  3e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000230505  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
406 aa  196  6e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1234  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 
406 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1043  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
411 aa  195  9e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.333439  hitchhiker  0.00192183 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2238  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  33.25 
 
 
413 aa  195  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.352905  hitchhiker  0.000738733 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1540  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
411 aa  194  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1474  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 
411 aa  192  6e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.260461  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1668  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.7 
 
 
411 aa  188  1e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00087523 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0007  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  33.33 
 
 
419 aa  188  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1567  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  30.99 
 
 
429 aa  187  3e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0159042  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1046  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  31.89 
 
 
426 aa  180  4e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.822393  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0645  phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 
406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.4805  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2732  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
392 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0340  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  32.94 
 
 
421 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.236213  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1062  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.15 
 
 
401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000191517  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1050  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.54 
 
 
401 aa  151  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.579246  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0537  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 
428 aa  150  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2948  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 
403 aa  150  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2232  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.18 
 
 
408 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2095  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
378 aa  144  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0717657 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0466  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  28.57 
 
 
409 aa  143  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0081  Phosphoglycerate mutase  28.32 
 
 
409 aa  143  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0139  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  30.08 
 
 
403 aa  143  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0732  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.86 
 
 
401 aa  139  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.17972  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0773  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  29.6 
 
 
402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813794  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1409  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.53 
 
 
402 aa  137  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0673  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  28.75 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.739851  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0743  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.72 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_650  phophosphoglycerate mutase AP superfamily  27.5 
 
 
401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1566  phosphoglycerate mutase  25.69 
 
 
426 aa  119  7e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1600  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.38 
 
 
409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.969121  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1414  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0339  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  23.8 
 
 
432 aa  113  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.800156  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0840  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  25.82 
 
 
426 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1111  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  24.44 
 
 
426 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1117  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  25.06 
 
 
426 aa  106  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.822723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0824  phosphonopyruvate decarboxylase-related protein  27.59 
 
 
433 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000255379  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1008  phosphoglycerate mutase  22.73 
 
 
428 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.27356  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1620  phosphoglycerate mutase  23.45 
 
 
428 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.549982  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0294  phosphoglycerate mutase  21.97 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  31.43 
 
 
317 aa  63.5  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1250  hypothetical protein  22.55 
 
 
350 aa  60.1  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00240974  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1820  putative signal peptide protein  32.04 
 
 
339 aa  57.4  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0395  regulatory protein  31.71 
 
 
306 aa  57  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0454  regulatory protein  31.71 
 
 
306 aa  56.6  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  26.75 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  33.02 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00084  RpfE regulatory protein  31.65 
 
 
306 aa  53.5  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.620416  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1970  hypothetical protein  32.88 
 
 
356 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00552765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  25.85 
 
 
334 aa  52.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2837  hypothetical protein  25.43 
 
 
345 aa  52.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.601458  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1470  phosphoglycerate mutase  20.47 
 
 
429 aa  51.2  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1814  regulatory protein  32.26 
 
 
305 aa  50.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0110601  normal  0.0340193 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1459  hypothetical protein  29.75 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1075  hypothetical protein  25.26 
 
 
366 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0562211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>