20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1757 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1757  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  773    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.870085  normal  0.146443 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1188  signal peptide protein  24.2 
 
 		 351 aa  59.7  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2416  hypothetical protein  24.07 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.845758  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2382  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  26.14 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.827176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2464  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  24.19 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00281274  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0839  phosphoglycerate mutase  25.1 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.654535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1058  proposed homoserine kinase  26.74 
 
 		 405 aa  47  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000198822  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1039  hypothetical protein  25.75 
 
 		 372 aa  46.6  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.306566 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0545  proposed homoserine kinase  25.83 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000221048  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5405  hypothetical protein  24.88 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.562328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1514  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  23.68 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0629609  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1982  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  24.4 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.19829  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1116  putative signal peptide protein  23.58 
 
 		 359 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0385568  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1459  hypothetical protein  23.18 
 
 		 341 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3701  hypothetical protein  24.14 
 
 		 318 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.811427 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0814  phosphoglycerate mutase  28.41 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1217  proposed homoserine kinase  25.45 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.755829  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1818  cofactor-independent phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 		 399 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1763  hypothetical protein  28.66 
 
 		 334 aa  43.5  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.724575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0123  hypothetical protein  24.55 
 
 		 317 aa  43.1  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>