More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1945 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1945  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 216 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2967  50S ribosomal protein L4  77.34 
 
 		 204 aa  317  7.999999999999999e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.191884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  54.15 
 
 		 206 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2533  50S ribosomal protein L4  55.61 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0584  50S ribosomal protein L4  54.63 
 
 		 206 aa  212  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0362  50S ribosomal protein L4  55.12 
 
 		 206 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1717  50S ribosomal protein L4  55.12 
 
 		 206 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0247  50S ribosomal protein L4  52.94 
 
 		 205 aa  209  3e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.767965  normal  0.730186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0277  50S ribosomal protein L4  54.41 
 
 		 205 aa  208  6e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2124  50S ribosomal protein L4  53.66 
 
 		 206 aa  203  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0760  50S ribosomal protein L4  55.61 
 
 		 206 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0352  50S ribosomal protein L4  53.66 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2441  50S ribosomal protein L4  52.2 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2163  50S ribosomal protein L4  52.2 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1909  50S ribosomal protein L4  52.68 
 
 		 206 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00049189  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2219  50S ribosomal protein L4  51.71 
 
 		 206 aa  194  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1680  50S ribosomal protein L4  50.24 
 
 		 206 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.097299  hitchhiker  0.0000499421 
 
 
-
 
NC_004310  BR1232  50S ribosomal protein L4  49.76 
 
 		 206 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24642  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1957  50S ribosomal protein L4  50.24 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1195  50S ribosomal protein L4  49.76 
 
 		 206 aa  191  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280242  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0579  50S ribosomal protein L4  50.24 
 
 		 206 aa  187  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0611  50S ribosomal protein L4  45.1 
 
 		 205 aa  187  9e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.937443  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1546  50S ribosomal protein L4  48.78 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1677  50S ribosomal protein L4  49.27 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1365  50S ribosomal protein L4  48.78 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65413  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3447  50S ribosomal protein L4  48.78 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0267  ribosomal protein L4  48.84 
 
 		 214 aa  184  7e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000000335514  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0410  50S ribosomal protein L4  45.1 
 
 		 205 aa  184  7e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0680  50S ribosomal protein L4  47.06 
 
 		 204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0323983  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  50.73 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3666  50S ribosomal protein L4  50.73 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1431  50S ribosomal protein L4  47.32 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112454  normal  0.0117604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1333  50S ribosomal protein L4  47.8 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.177589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1352  50S ribosomal protein L4  52.4 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.149539 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3183  50S ribosomal protein L4  49.27 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5069  50S ribosomal protein L4  47.8 
 
 		 206 aa  178  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.312873  normal  0.444752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2296  50S ribosomal protein L4  49.27 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1355  50S ribosomal protein L4  44.88 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.700981  normal  0.0533022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1250  50S ribosomal protein L4  49.28 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.919527  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0667  50S ribosomal protein L4  45.85 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764856  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0699  50S ribosomal protein L4  45.85 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231924  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17340  Putative mitochondrial ribosomal protein L4  48.77 
 
 		 224 aa  173  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000952824  normal  0.0986734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1615  50S ribosomal protein L4  47.57 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.140901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2737  ribosomal protein L4/L1e  48.78 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.508185  normal  0.224795 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1841  50S ribosomal protein L4  47.32 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00656496  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2817  50S ribosomal protein L4  49.52 
 
 		 208 aa  171  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1794  50S ribosomal protein L4  46.92 
 
 		 211 aa  170  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130776  normal  0.0731355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  44.66 
 
 		 207 aa  161  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  45.36 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  44.85 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  46.11 
 
 		 206 aa  151  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  43.98 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  44.71 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 		 206 aa  141  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  41.12 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  45.56 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  43.81 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  39.45 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2618  50S ribosomal protein L4/L1e  40.8 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0455519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  42.49 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  41.97 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  38.86 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  37.44 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  39.3 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  43.27 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  40.21 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0266  50S ribosomal protein L4  42.27 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  41.45 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  39.69 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  41.45 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4314  ribosomal protein L4/L1e  41.59 
 
 		 216 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  38.42 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  39.9 
 
 		 207 aa  131  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  38.05 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  38.12 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  42.49 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  36.63 
 
 		 205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  41 
 
 		 223 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  41.58 
 
 		 207 aa  128  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  39.06 
 
 		 206 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1306  50S ribosomal protein L4  41.92 
 
 		 219 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265076  normal  0.163333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0689  ribosomal protein L4/L1e  40.1 
 
 		 234 aa  127  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  45.08 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  38.89 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  42.49 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  36.45 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  39.89 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  41.4 
 
 		 207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1417  ribosomal protein L4/L1e  38.28 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.977567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>