More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1615 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1615  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 212 aa  424  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.140901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1909  50S ribosomal protein L4  64.56 
 
 		 206 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00049189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0352  50S ribosomal protein L4  62.14 
 
 		 206 aa  265  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3447  50S ribosomal protein L4  63.59 
 
 		 206 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0579  50S ribosomal protein L4  63.11 
 
 		 206 aa  262  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1794  50S ribosomal protein L4  60.66 
 
 		 211 aa  262  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130776  normal  0.0731355 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2296  50S ribosomal protein L4  64.08 
 
 		 206 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.214587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3183  50S ribosomal protein L4  63.59 
 
 		 206 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.611189 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3666  50S ribosomal protein L4  63.59 
 
 		 206 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1680  50S ribosomal protein L4  61.17 
 
 		 206 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.097299  hitchhiker  0.0000499421 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  63.59 
 
 		 206 aa  257  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1841  50S ribosomal protein L4  63.59 
 
 		 206 aa  256  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00656496  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1355  50S ribosomal protein L4  61.65 
 
 		 206 aa  256  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.700981  normal  0.0533022 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1546  50S ribosomal protein L4  62.14 
 
 		 206 aa  256  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1365  50S ribosomal protein L4  61.17 
 
 		 206 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65413  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1957  50S ribosomal protein L4  62.14 
 
 		 206 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0135033  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2219  50S ribosomal protein L4  62.14 
 
 		 206 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1431  50S ribosomal protein L4  61.65 
 
 		 206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112454  normal  0.0117604 
 
 
-
 
NC_004310  BR1232  50S ribosomal protein L4  61.17 
 
 		 206 aa  252  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.24642  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1195  50S ribosomal protein L4  61.17 
 
 		 206 aa  252  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.280242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5069  50S ribosomal protein L4  61.65 
 
 		 206 aa  252  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.312873  normal  0.444752 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1333  50S ribosomal protein L4  62.14 
 
 		 206 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.177589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2124  50S ribosomal protein L4  60.19 
 
 		 206 aa  250  8.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2163  50S ribosomal protein L4  59.71 
 
 		 206 aa  249  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.591953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2441  50S ribosomal protein L4  59.71 
 
 		 206 aa  249  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1677  50S ribosomal protein L4  60.68 
 
 		 206 aa  247  8e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0699  50S ribosomal protein L4  60.19 
 
 		 206 aa  246  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000231924  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0667  50S ribosomal protein L4  60.19 
 
 		 206 aa  246  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764856  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2737  ribosomal protein L4/L1e  61.17 
 
 		 206 aa  241  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.508185  normal  0.224795 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0584  50S ribosomal protein L4  53.88 
 
 		 206 aa  221  6e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0277  50S ribosomal protein L4  55.83 
 
 		 205 aa  220  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.187422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  54.37 
 
 		 206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0760  50S ribosomal protein L4  54.85 
 
 		 206 aa  211  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.536286  normal  0.490567 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2533  50S ribosomal protein L4  52.43 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1717  50S ribosomal protein L4  52.91 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0362  50S ribosomal protein L4  52.91 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0247  50S ribosomal protein L4  52.91 
 
 		 205 aa  207  7e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.767965  normal  0.730186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2967  50S ribosomal protein L4  49.76 
 
 		 204 aa  193  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.191884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2817  50S ribosomal protein L4  50.49 
 
 		 208 aa  188  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.477285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1352  50S ribosomal protein L4  51.69 
 
 		 208 aa  188  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.149539 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1250  50S ribosomal protein L4  53.11 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.919527  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  47.29 
 
 		 206 aa  174  8e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1945  50S ribosomal protein L4  47.57 
 
 		 216 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17340  Putative mitochondrial ribosomal protein L4  45.1 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000952824  normal  0.0986734 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  41.75 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  41.26 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  40.29 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  38.16 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0611  50S ribosomal protein L4  39.81 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.937443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  38.35 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  39.32 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  42.21 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  39.7 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  39.7 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  37.07 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  41.06 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0410  50S ribosomal protein L4  38.35 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  41.06 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  41.83 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  38.83 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1866  50S ribosomal protein L4  42.08 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0257015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  40.93 
 
 		 207 aa  143  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  37.68 
 
 		 208 aa  141  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  40.1 
 
 		 207 aa  141  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0266  50S ribosomal protein L4  43.81 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651042  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  36.76 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  37.86 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  37.56 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  39.81 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  41.83 
 
 		 206 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  41.83 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  40.1 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  39.81 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  38.12 
 
 		 206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  38.83 
 
 		 206 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  35.92 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0267  ribosomal protein L4  40.95 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000000335514  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3922  ribosomal protein L4/L1e  41.29 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  36.36 
 
 		 208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  36.36 
 
 		 207 aa  135  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0680  50S ribosomal protein L4  36.89 
 
 		 204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0323983  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  36.89 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  37.88 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  38.19 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  37.8 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000586581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  38.54 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  38.54 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  36.1 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3142  ribosomal protein L4/L1e  38.03 
 
 		 221 aa  131  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.083105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  34.65 
 
 		 207 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  39.15 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>