More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0423 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 207 aa  420  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  62.8 
 
 		 207 aa  266  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  60.39 
 
 		 207 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  61.35 
 
 		 207 aa  259  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  258  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  258  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  258  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  258  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  258  6e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  258  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  258  6e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  258  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  60.87 
 
 		 207 aa  258  6e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  61.35 
 
 		 207 aa  256  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  60.39 
 
 		 206 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  57.97 
 
 		 207 aa  247  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  58.45 
 
 		 206 aa  241  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  56.52 
 
 		 206 aa  237  8e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  53.62 
 
 		 207 aa  234  7e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  54.11 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  54.33 
 
 		 208 aa  231  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  53.14 
 
 		 207 aa  227  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  53.62 
 
 		 207 aa  225  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  53.62 
 
 		 204 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  53.62 
 
 		 204 aa  225  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  49.76 
 
 		 207 aa  225  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  52.88 
 
 		 208 aa  224  7e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  56.04 
 
 		 206 aa  224  8e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  51.69 
 
 		 206 aa  224  9e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  50.24 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  51.46 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  54.81 
 
 		 209 aa  215  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  49.51 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  49.51 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  48.79 
 
 		 207 aa  211  7e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  48.79 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  52.43 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  50.24 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  50.24 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  47.6 
 
 		 208 aa  201  6e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  47.34 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  46.86 
 
 		 207 aa  198  5e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  47.09 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  50.49 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  49.24 
 
 		 223 aa  194  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  45.15 
 
 		 207 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  48.73 
 
 		 221 aa  192  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  47.09 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 208 aa  191  5e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  47.39 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  47.39 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  47.12 
 
 		 207 aa  188  5e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  45.15 
 
 		 207 aa  188  5e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  49.76 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  48.53 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  46.89 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  47.37 
 
 		 212 aa  184  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  47.87 
 
 		 210 aa  184  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  45.7 
 
 		 221 aa  184  9e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17391  50S ribosomal protein L4  45.5 
 
 		 210 aa  181  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  47.09 
 
 		 206 aa  181  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  44.14 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  47.32 
 
 		 222 aa  181  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  42.53 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  45.59 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1616  ribosomal protein L4/L1e  44 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  46.31 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  46.31 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  45.15 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000340203  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  45.15 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  45.63 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  45.58 
 
 		 235 aa  174  6e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  45.58 
 
 		 235 aa  174  6e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  43.96 
 
 		 207 aa  173  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1649  50S ribosomal protein L4  43.13 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  46.73 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1417  ribosomal protein L4/L1e  43.69 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.977567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  45.89 
 
 		 206 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17641  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17481  50S ribosomal protein L4  42.65 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.533381  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  43.75 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  43 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  42.36 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  43.96 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  44.93 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 		 207 aa  168  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 		 207 aa  168  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  42.03 
 
 		 209 aa  167  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  45.64 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2295  50S ribosomal protein L4  44.44 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0333756  hitchhiker  0.00351228 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  43.2 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16771  50S ribosomal protein L4  43.54 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  44.72 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000586581  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20021  50S ribosomal protein L4  42.51 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>